AIS je Informační systém veřejné správy, který slouží pro podporu agendy veřejné správy. Jde o systém, v němž se Agendy veřejné správy vykonávají, nebo se v něm vedou Agendové údaje. AIS povinně využívá Referenční rozhraní a využívá služby ISZR pro využívání referenčních údajů a služby EGSB/ISSS pro využívání agendových údajů a poskytování agendových údajů. Za AIS zodpovídá vždy Orgán veřejné moci, který je Správce ISVS, je tedy zároveň v roli Správce AIS.

Agendový informační systém je ohlášen v RPP, a to konkrétně v Rejstříku ISVS, to z něj ale ještě nedělá AIS. Teprve vazba na konkrétní agendu (či agendy) jej činí AISem, i toto je ohlášeno v RPP. V agendovém informačním systému se také vedou jednotlivé Agendové údaje, což je také součástí ohlášení agendy v RPP. To ohlásí Ohlašovatel agendy, ten je zároveň buď sám správcem AIS, nebo je správcem AIS OVM působící v dané agendě. Platí, že pro jednu agendu může být více AIS a naopak jeden AIS může sloužit pro podporu více agend.

Aby AIS splňoval požadavky na výměnu údajů (propojený datový fond), má realizovat Typizované aplikační služby AISu pro splnění povinností souvisejících s údaji. Technické podrobnosti napojení AIS na referenční rozhraní najdete třeba na pro správce agendových informačních systémů.