Propojený datový fond obsahuje referenční údaje.

Referenční údaje jsou údaje vedené v základních registrech, které definuje 111/2009 Sb. (zákon o základních registrech) jako referenční pro jednotlivé registry. Subjekt či objekt existuje, jelikož jeho Referenční identita je v příslušném základním registru a podrobnosti jsou právě referenční údaje. Orgán veřejné moci realizuje Využívání referenčních údajů, každý editor příslušného referenčního údaje zodpovídá za jeho správnost a za aktuálnost zápisu v základním registru.

Referenčními údaji jsou referenční údaje o osobě v Registru obyvatel, referenční údaje o subjektu v Registru osob, referenční údaje v Registru územní identifikace adres a nemovitostí, referenční údaje o agendách v Registru práv a povinností, referenční údaje o skutečnostech v Registru práv a povinností a referenční údaje o rozhodnutích a o právech a povinnostech v Registru práv a povinností.

• Referenční údaje zapisuje stanovený editor prostřednictvím editorského systému do příslušného základního registru.
• Orgán veřejné moci musí povinně využívat referenční údaje nehledě na konkrétní oprávnění v jednotlivých zákonech, musí udržovat dle své potřeby aktuálnost údajů a musí plnit i další povinnosti, jako je reklamace údajů apod.
• Soukromoprávní uživatel údajů může a musí využívat referenční údaje pokud tak stanoví konkrétní zákon a to pouze v rozsahu oprávnění dle tohoto zákona.
• Referenční údaje jsou vázány na identitu reprezovanou příslušným identifikátorem, třeba u fyzických osob je to AIFO, u právnických subjektů je to ic, u agend je to Kód agendy, apod.
• Přístup k referenčním údajům je realizován prostřednictvím ISZR a smí k nim přistupovat pouze řádný agendový informační systém dle ohlášení v příslušné agendě, jak stanoví Agendový model veřejné správy.
• Referenční údaj se automaticky neověřuje a je považován za správný, není-li označen reklamací za zpochybněný. OVM a SPUÚ nesmí po klientovi referenční údaj vyžadovat a požadovat jeho doložení.