Referenční rozhraní obsahuje Informační systém základních registrů (ISZR), prostřednictvím kterého subjekt v roli Orgán veřejné moci dle obecných ustanovení a v roli soukromoprávní uživatel údajů dle konkrétního oprávnění, využívají (a v případě editorů editují) Referenční údaje a další nereferenční údaje v jednotlivých základních registrech. Stručně řečeno, OVM nikdy nepřistupuje přímo k jednotlivým registrům, ale využívá jako rozhraní a mezivrstvu pro jednotné služby právě tento ISZR. ISZR a jeho fungování upravuje zákon 111/2009 Sb. (zákon o základních registrech) a jako součást referenčního rozhraní je pro Využívání referenčních údajů povinné.

Veškeré potřebné technické a procesní podrobnosti jsou uvedeny na webových stránkách k základním registrům a to zejména v sekcích pro orgány veřejné moci a pro vývojáře agendových informačních systémů, k dispozici je pak i Podrobný popis EGON služeb základních registrů.

K rozhraní a službám ISZR může být připojen pouze agendový informační systém a nebo informační systém soukromoprávního uživatele údajů zapsaný v Rejstřík ISVS.